GWASとは？PRSの土台になる研究をやさしく解説

GWAS（ゲノムワイド関連解析）は、PRSの土台になる研究のやり方のことだよ。ゲノム全体を端から端まで見渡して、「この病気の人に多く見られる場所はどこか」を統計的に探す研究なんだ。

いいたとえだね。具体的には、その病気になった人たち（症例群）と、なっていない人たち（対照群）を大勢集めて、ゲノム上の何十万、何百万というSNPを一つひとつ比較する。あるSNPの型が症例群に明らかに多ければ、その付近が病気と関係している可能性が浮かび上がるわけ。

数万人から、大規模なものだと100万人規模になることもあるよ。

生活習慣病や一般的ながんの場合、SNP1つあたりの影響はとても小さいんだ。オッズ比でいえば1.05とか1.1とか、その程度。小さな差を偶然と区別するには、大人数が必要になる。しかも何十万カ所も同時に検定するから、たまたま差が出てしまう場所も必ず現れる。だからGWASでは、よく使われるp<0.05ではなく、5×10のマイナス8乗（0.00000005）という桁違いに厳しい基準を使うんだよ。

GWASからは、SNPごとの「効果量」、つまりどのくらいリスクに影響するかの重みが得られる。PRSは、その人が持っているリスク型の数に、それぞれの重みを掛けて、全部足し合わせたものなんだ。1つ1つは小さくても、何千、何万と積み上げると、集団の中での相対的な位置が見えてくる。

まさに。ただし気をつけてほしいことがある。GWASでわかるのは「関連がある」ということであって、「その遺伝子が原因だ」とは限らないんだ。すぐ近くにある本当の原因を、たまたま一緒に検出しているだけ、ということもある。

そう。だから健保さんが事業者の資料を見るときは、「論文があります」で終わらせないでほしい。確認したいのはこの7つ。対象の病気の定義、症例と対照の人数、参加者はどの集団か、PRSを作ったデータと性能を確かめたデータが分かれているか、別の集団でも再現されているか、効果量と信頼区間、そして研究自身が挙げている限界だよ。

全部を理解する必要はないよ。大事なのは「サービスが表示している結果と、根拠となる論文が、たどって対応づけられるか」。論文の本数が多いことより、そのつながりが見えることのほうがずっと重要なんだ。

その通り。それにGWASは日々更新されていく研究分野でもある。新しいデータが加わればPRSも作り直されるから、いつ時点のどの研究にもとづくのかを明示している事業者は、それだけで信頼できるサインだよ。

いい引っかかり方だ！ここは混同されやすいから、はっきり分けておこう。変わらないのは遺伝情報そのもの。だから検体を採り直す必要は原則としてない。一方、更新されるのは解析のほうなんだ。新しい研究が積み上がれば、対象の疾患が追加されたり、スコアの算出方法が見直されたりする。同じ検体データから、より新しい解析結果を返せる、ということだね。

そういうこと。だから加入者の方に説明するときも、「一生変わりません」と「結果が更新されることがあります」を並べて言うと矛盾して聞こえてしまう。「変わらないのは遺伝情報、更新されるのは解析」。この一文をあらかじめ用意しておくと、説明がぶれないよ。